上海交通大学食品科学与工程专业始建于1993年，历经30年的筚路蓝缕，已经初见成效，建有食品科学与工程一级硕士点和一级博士点，先后获批教育部特色专业（2010）、上海市一流学科（2015）、国家一流本科专业建设点（2022），实现了“本-硕-博”贯通的培养模式。

食品科学与工程专业始终秉持 “价值引领、知识探究、能力建设、人格养成”四位一体的教育理念，旨在培养“德智体美劳”全面发展并具有国际视野的卓越拔尖食品专业人才。近年来围绕工程教育认证标准，专业建设以学生为中心，积极完善培养方案和人才培养条件。食品科学与工程专业专业于2019年10月向中国工程教育专业认证协会提出认证申请。随后，在学校学院各级领导和各部门的大力支持、以及全系教职工的努力配合下，经过积极筹备、认真总结、对照整改等工作，食品科学与工程专业通过了专业认证申报、专业自评、专家现场考察和协会审查，顺利通过工程教育认证专业认证。进校专家组也高度评价了本专业建设成绩，认定专业课程体系设置、师资队伍配备、办学条件配置等均围绕培养目标和毕业能力达成展开,并建立了有效的专业持续改进机制，教育教学质量和水平达到了国际工程教育专业认证要求。